Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IP78347 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms