Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms