Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL30P62888 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL30P62888 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL30P62888 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL30P62888 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL30P62888 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL30P62888 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms