Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO4P61968 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms