Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms