Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms