Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBASH3AP57075 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms