Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP7P55210 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP7P55210 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP7P55210 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP7P55210 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASP7P55210 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASP7P55210 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP7P55210 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms