Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LBX1P52954 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBX1P52954 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBX1P52954 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBX1P52954 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LBX1P52954 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBX1P52954 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBX1P52954 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBX1P52954 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LBX1P52954 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LBX1P52954 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LBX1P52954 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBX1P52954 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LBX1P52954 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBX1P52954 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBX1P52954 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms