Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA3P52797 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA3P52797 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms