Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF6P49848 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF6P49848 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF6P49848 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6P49848 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF6P49848 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF6P49848 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms