Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP4P49662 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP4P49662 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP4P49662 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP4P49662 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP4P49662 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP4P49662 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP4P49662 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP4P49662 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms