Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNTBP49356 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNTBP49356 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNTBP49356 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNTBP49356 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FNTBP49356 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FNTBP49356 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms