Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLCP48506 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCLCP48506 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCLCP48506 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCLCP48506 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCLCP48506 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCLCP48506 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCLCP48506 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCLCP48506 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCLCP48506 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms