Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RANGAP1P46060 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms