Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZEB1P37275 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms