Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FDFT1P37268 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms