Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL4P36578 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL4P36578 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL4P36578 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms