Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms