Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGER4P35408 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms