Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTX1P32242 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX1P32242 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX1P32242 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX1P32242 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX1P32242 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX1P32242 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTX1P32242 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTX1P32242 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTX1P32242 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTX1P32242 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX1P32242 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX1P32242 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX1P32242 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX1P32242 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX1P32242 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX1P32242 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX1P32242 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTX1P32242 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms