Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKARP32238 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKARP32238 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCKARP32238 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCKARP32238 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCKARP32238 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms