Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB4P28070 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB4P28070 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms