Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB2P26583 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB2P26583 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms