Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DNMT1P26358 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DNMT1P26358 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms