Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FGFR3P22607 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGFR3P22607 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGFR3P22607 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGFR3P22607 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FGFR3P22607 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms