Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VDAC1P21796 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms