Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCLP19338 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCLP19338 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCLP19338 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCLP19338 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCLP19338 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCLP19338 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCLP19338 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCLP19338 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCLP19338 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCLP19338 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCLP19338 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCLP19338 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms