Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA6P17658 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA6P17658 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms