Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYN1P17600 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYN1P17600 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYN1P17600 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYN1P17600 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYN1P17600 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYN1P17600 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYN1P17600 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYN1P17600 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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