Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCFC2P16383 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCFC2P16383 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms