Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VEGFAP15692 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFAP15692 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms