Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB3P14651 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms