Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD8P13378 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms