Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A1P11836 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A1P11836 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms