Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH3P11055 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH3P11055 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYH3P11055 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYH3P11055 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH3P11055 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH3P11055 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH3P11055 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH3P11055 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH3P11055 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms