Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX5BP10606 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX5BP10606 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX5BP10606 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX5BP10606 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX5BP10606 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX5BP10606 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX5BP10606 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX5BP10606 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX5BP10606 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX5BP10606 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX5BP10606 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX5BP10606 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX5BP10606 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX5BP10606 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX5BP10606 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX5BP10606 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COX5BP10606 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX5BP10606 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX5BP10606 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COX5BP10606 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX5BP10606 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX5BP10606 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms