Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP1P09874 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP1P09874 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP1P09874 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP1P09874 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP1P09874 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP1P09874 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP1P09874 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP1P09874 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP1P09874 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP1P09874 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP1P09874 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP1P09874 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP1P09874 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms