Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB5P09067 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms