Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDHBP07195 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDHBP07195 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDHBP07195 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDHBP07195 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDHBP07195 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDHBP07195 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDHBP07195 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LDHBP07195 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDHBP07195 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDHBP07195 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDHBP07195 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms