Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB3P05106 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms