Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A1BGP04217 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A1BGP04217 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A1BGP04217 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
A1BGP04217 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
A1BGP04217 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A1BGP04217 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A1BGP04217 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A1BGP04217 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A1BGP04217 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A1BGP04217 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A1BGP04217 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A1BGP04217 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
A1BGP04217 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A1BGP04217 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A1BGP04217 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A1BGP04217 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A1BGP04217 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A1BGP04217 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A1BGP04217 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A1BGP04217 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A1BGP04217 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A1BGP04217 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
A1BGP04217 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A1BGP04217 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A1BGP04217 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A1BGP04217 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms