Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POP4O95707 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POP4O95707 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POP4O95707 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POP4O95707 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POP4O95707 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms