Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB11O95342 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms