Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBTB3O94955 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBTB3O94955 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms