Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN15O75808 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms