Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms