Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAMP4O75379 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms