Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPINK4O60575 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms