Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP2AO43633 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms